碳排放配额分配机制是碳市场运行的核心制度基础。五矿证券研报系统拆解了广东碳市场的配额分配方法——基准线法覆盖电力、钢铁、水泥、造纸等行业的部分工序，历史法（历史排放法+历史强度法）覆盖石化、民航、陶瓷、交通、数据中心及纺织等。广东碳市场实行“免费发放+有偿发放”相结合，21次有偿发放获8.35亿元收入，2017年后PHCER基本替代配额有偿发放（36次竞价成交171.55万吨）。不同分配方法的选择深刻影响着各行业企业的碳配额盈亏与减排激励。

广东碳市场对不同行业采用差异化的配额分配方法。基准线法适用于产品品种单一、工艺流程相对标准化的行业，如电力（燃煤燃气发电机组）、水泥（熟料生产和粉磨）、钢铁（炼焦、石灰烧制、球团、烧结、炼铁、炼钢工序）、造纸（机制纸和纸板、纸制品）。基准线法的核心是设定行业平均排放强度基准，企业实际排放低于基准则获得盈余配额，高于基准则产生缺口，形成“鞭策落后、奖励先进”的减排激励。

历史法适用于产品品种多样、工艺流程差异较大的行业，包括历史排放法和历史强度法。石化行业采用历史排放法（配额=前3年历史加权平均排放量×年度下降系数），民航行业采用历史强度法（全面服务航空企业基准值×实际收入吨公里×年度下降系数）。2023年新纳入的陶瓷、交通、数据中心也采用历史法。历史法的特点是配额分配与企业历史排放挂钩，对行业冲击较小但减排激励弱于基准线法。

广东碳市场配额分配从一开始就实行“免费发放+有偿发放”相结合。2021年前电力行业免费配额比例95%，钢铁、石化、水泥、造纸、航空均为97%。2021年后钢铁、石化、水泥、造纸降至96%，航空业100%免费发放。2023年新纳入行业免费配额比例97%。有偿发放比例维持在5%以内，避免对行业造成过度冲击。

成立至今共开展21次配额有偿发放活动，获得8.35亿元收入。有偿配额发放累计3015.66万吨，竞买总量1816.69万吨（占发放60.2%）。2017年7月前开展19次拍卖（获8.04亿元，占96.3%）。2018年职能转交后，2020年开展2次竞价（成交量109.50万吨，收入1959.44万元）。有偿发放收入属政府非税收入，全额纳入财政“收支两条线”管理，用于支持企业节能减排技术改造。

2017年后省级核证自愿减排量（PHCER）作为抵消碳排放配额履约的补充机制，基本替代碳排放配额有偿发放。2017年至2025年初共组织36次PHCER竞价活动，成交量171.55万吨。林业碳普惠项目占96.6%（165.76万吨），分布式光伏发电碳普惠项目占3.4%（5.79万吨）。

PHCER竞价设置竞价底价，底价根据前三个月广东碳市场配额挂牌点选加权平均成交价（或80%）计算。2021年9月前16次竞价成交量117.82万吨（占68.7%），平均底价23.70元/吨，流拍次数为0。2023年9月后16次竞价成交量53.7万吨（占31.3%），平均底价65.45元/吨，流拍次数明显增多。PHCER用于抵消的核证自愿减排量不得超过企业年度实际碳排放量的10%，且提交的CCER中70%以上须为本省CCER或PHCER。

广东碳市场的配额分配机制设计体现了“适度从紧、逐步收紧”的政策思路。基准线法的行业覆盖范围逐步扩大（从电力到水泥、钢铁、造纸），历史法的行业不断向基准线法过渡（如钢铁2019年从粗钢基准转为多工序基准）。免费配额比例逐步降低（钢铁、石化、水泥、造纸从97%降至96%），有偿发放机制持续运行。

配额分配方法的差异直接影响各行业企业的碳成本。基准线法行业面临更强的减排压力和更大的碳配额盈亏弹性，历史法行业碳成本相对平稳。碳市场配额分配机制的设计需要在“减排激励强度”和“行业承受能力”之间寻求平衡。企业应深入研究所在行业的配额分配方法，精准评估碳资产盈亏状况，积极通过节能降碳技术改造获取碳配额盈余。